除了外观丑陋和手脚变粗之外，高水平的生长激素还可导致肢端肥大症患者的其他软组织、骨骼和内部器官增大。肢端肥大症对心血管系统的影响非常重要，以至于这类疾病被称为 "肢端肥大症心脏病"，是肢端肥大症患者的主要死因。
肢端肥大症患者的死亡率比正常人高30%，其中心脏病变占总死亡率的60%。肥大性心脏病见于约20%的无高血压且病程较短的患者，以及90%的合并高血压且病程较长的患者。肥厚性心脏病的表现多种多样：（1）心血管结构性变化，如心肌增厚、心房和心室扩大、主动脉等大血管内径增宽和心脏瓣膜病变；（2）心脏功能的变化，如舒张功能障碍、心律失常和收缩功能障碍。患者最终会出现心血管病变，导致心功能不全，甚至心力衰竭。
最近的研究表明，肢端肥大症患者心血管系统病变的独立危险因素是高龄、肥胖和病程长。因此，早期识别疾病，将患者入院时的年龄控制在较小的范围内并相应缩短病程，以及指导患者保持健康体重，是预防肢端肥大症患者心血管病变的有效方法。
