睡覺磨牙是由於咀嚼肌的持續收縮引起的，而咀嚼肌的運動又是受三叉神經支配的，所以，凡是能影響到三叉神經和咀嚼肌的因素，都可以引起睡覺磨牙，其發病原因一般認為與下列因素有關：
(1)白天玩得太興奮，過於激動或疲勞，或受了驚嚇，或白天學習緊張，使其大腦皮層的興奮和抑制過程失去平衡，誘發咀嚼肌的運動發生一時性不規則的痙攣或收縮，產生了夜間磨牙。
(2)腸道寄生蟲病。認為腸道寄生蟲是引起幼兒夜間磨牙的最主要原因。蛔蟲最喜歡在孩子睡著了以後在腸子裡活動，並且分泌多種毒素。些都刺激腸壁，通過神經系統的作用，會不斷地刺激熟睡中孩子的大腦皮層，使之出現咀嚼肌的痙攣而磨牙。
(3)積食。比如睡前吃得過飽，大量食物充斥胃腸而刺激了消化道，神經把這些刺激傳到大腦，使管理消化的腦細胞興奮起來，通過反射作用，引起咀嚼。但由於嘴裡沒有食物，上牙和下牙就直接磨起來，產生了咯吱咯吱的咬牙聲。
