1.低血糖：
2型糖尿病患者發生低血糖的主要原因是降糖藥物的應用。磺脲類、格列奈類促泌劑、胰島素可以增加低血糖風險;而雙胍類、α糖苷酶抑制劑、噻唑烷二酮類等藥物單用一般不發生低血糖。其他危險因素還包括老年、病程長、飲食不規律等。
2.體重增加：
多項研究顯示，體重增加是胰島素、促胰島素分泌劑和TZD類藥物治療的常見副作用。引起體重增加的機制包括藥物的胰島素同化作用(促進脂肪、蛋白質和糖原合成，引起飢餓感和熱量攝入增多)，以及體液瀦留。
3.胃腸道不良反應：
二甲雙胍所致消化道反應較常見，發生率為5%~20%;α糖苷酶抑制劑亦可導致胃腸脹氣和腸鳴音亢進等不良反應，但在ACE研究中，α糖苷酶抑制劑組基本沒有因為胃腸道不良反應而退出研究者。
4.心血管安全性：
既往研究顯示，羅格列酮可導致糖尿病患者心肌梗死(MI)風險和心血管死亡風險增加。大型研究的部分亞組分析顯示雙胍類、α糖苷酶抑制劑治療降低心血管事件發生率。目前，正在進行一項以中國為主的全球多中心隨機對照雙盲研究(ACE)，旨在判斷阿卡波糖是否能夠降低明確的心血管疾病合併糖代謝異常患者的心血管相關發病率和死亡率。
