一般認為，唇裂的發生是由於中鼻翼下端的球狀突與上頜突未能及時融合（在胎兒出生後第7周）。相反，先天性顎裂是由於兩個顎突未能及時與鼻中隔融合（在胎兒出生後第10周）。導致融合失敗的因素還不完全清楚，可能與遺傳、營養、內分泌或感染、外傷等有關。治療方法必須是修復手術。唇裂手術的主要目的是整形，而先天性顎裂的手術是為了恢復進食和說話的功能。通常在1-3歲進行，往往需要幾次手術才能完成，術後應進行語言訓練。
必須進行修復手術。唇顎裂手術的主要目的是美容，而先天性顎裂的主要目的是恢復飲食和語言功能。手術必須在適當的年齡進行，這對手術後的長期效果具有決定性意義。
I.唇裂的修復
早期手術，效果良好。大多數人認為，嬰兒在2-3個月大時比較合適。如果護理情況滿意，嬰兒的生理性黃疽消失，體重恢復到出生時的水平，嬰兒對手術的耐受能力增強，就可以進行修復手術。雙側唇裂手術應推遲到6個月大。還應考慮到孩子的健康、營養狀況和氣候條件。總之，儘量在1歲內完成唇裂手術是很重要的。唇裂修復的方法有很多，最常見的是三角瓣術和旋轉推進術，這兩種方法的操作原理相同，只是切口的設計不同。一般來說，在裂縫的兩側選擇不同的基底，並根據這些基底進行切口，以去除裂縫的邊緣組織。然後將上唇上翻，在缺損兩側的齦唇溝處做一個放鬆的切口，將鼻基底、鼻翼和整個上唇與上頒骨膜完全分離。這樣一來，縫合處沒有張力，可以讓移位的鼻柱和唇人恢復到中間位置，也可以讓裂隙一側的畸形鼻翼（鼻孔）恢復正常形狀。最後，根據基點將肌肉、皮膚和粘膜分層縫合。由於這種手術的縫合線是鋸齒狀的。它遠遠優於以前的線性縫合，因為它可以避免因疤痕攣縮而出現的唇紅向上收縮（缺口）。
II.先天性顎裂的修復
手術年齡過早會阻礙上顱的正常發育，使顎部變窄和變短。導致上下牙齒的咬合出現障礙。反之，如果太晚，往往難以糾正病人的銜接。
為了既恢復正確的發音，又不妨礙上頜骨的正常發育，一般來說：
1.對於懸雍垂、軟性先天性顎裂或輕度軟硬性先天性顎裂，手術年齡為2-3歲。這些類型的先天性顎裂大多不妨礙上顱骨的正常發育。
2.對於嚴重的軟、硬性先天性顎裂，特別是完全性（貫通性）先天性顎裂，應在患兒5-6個月後首先修復唇裂和側鼻孔裂的基底，先天性顎裂的手術應推遲到4-5歲，此時上頜骨已發育到一定程度，手術不會引起嚴重的顎部變形，而且在患兒入學前（7歲以內）仍有足夠時間矯正其發音。
