生殖系統併發症
兒童患腮腺炎如果治療不徹底常會在成年後出現生殖系統併發症。由於腮腺炎病毒好侵犯成熟的生殖腺體，故在青春後期的成人患者較為多見。
1.睪丸炎：睪丸炎的發病率佔男性成人患者的14%～35%。一般13～14歲以後發病率明顯增高。常見於腮腫後一週左右，突發高熱、寒戰、睪丸腫痛、伴劇烈觸痛，重者陰囊皮膚顯著水腫，鞘膜腔內有黃色積液，病變大多侵犯一側，急性症狀約3～5日，全程10日左右。病後約1/3～1/2的病例發生不同程度的睪丸萎縮。由於病變常為單側，即使雙側也僅部分曲精管受累，故很少導致不育症。
2.卵巢炎：發生率約佔成年女性患者的5%～7%。症狀較輕，不影響受孕。主要表現為驟起畏寒、發熱，下腹部或腰骶部疼痛，月經週期失調，嚴重者可觸及腫大的卵巢，伴有壓痛，不影響生育力。
神經系統併發症
腮腺炎病毒可通過血腦屏障進入腦組織，引起一系列神經系統的併發症。
1.腦膜炎或腦膜腦炎：發病率為5%～25%，局部地區可高達35%。一般認為系該病毒直接侵入中樞神經系統所引起。腮腺腫前6天或腫後2周內出現，一般多在1周內發生。臨床表現為急性高熱伴劇烈頭痛、嘔吐、嗜睡或意識障礙，腦膜刺激徵陽性等，腦脊液檢查均呈病毒性腦炎或腦膜炎的改變。一般預後良好，個別重者可致死亡。
2.多發性神經炎、脊髓炎：較為少見，在腮腺炎後1～3周發生，預後良好。腫大的腮腺可能壓迫面神經引起暫時性面神經麻痺。有時出現平衡失調、三叉神經炎、偏癱、截癱、上升性麻痺等。偶見腦膜腦炎後因導水管狹窄，併發腦積水。
3.耳聾：表現為嘔吐、旋暈、耳鳴等症狀，主要是由內淋巴迷路炎及聽神經炎所致。雖然發病率很低(約1/15，000)，但可成為永久性和完全性耳聾，所幸多發生於單側(75%)，故仍能保留一定的聽力。
胰腺炎
腮腺炎併發胰腺炎的發生率為5%，在兒童少見。常發生於腮腺腫脹後1周左右，以中上腹劇痛和觸痛、肌緊張為主要症狀。伴嘔吐，發熱，腹脹便秘，有時可捫及腫大的胰腺。胰腺炎症狀多在一週消失。血清澱粉酶活力升高不能作為診斷的唯一依據，血清脂肪酶值超過1.5μ%(正常值0.2～0.7μ%)，提示近期有胰腺炎存在。
心肌炎
約有4%～5%的腮腺炎患者可發生心肌炎，心肌炎多見於病程5～10天。患者表現為面色蒼白、心率增快或緩慢、心音低鈍、心律不齊、暫時性心臟擴大、收縮期雜音。心電圖可見竇性停搏，房室傳導阻滯、st段壓低、t波低平或倒置等。嚴重者可致死。但多數僅有心電圖改變而無明顯臨床病狀。偶有心包炎。
腎炎
腮腺炎病毒可直接損害腎臟引起腎炎，輕者尿中有少量蛋白，重症與急性腎小球腎炎的表現相同。在腮腺炎早期可從患者尿中分離出腮腺炎病毒，個別嚴重者可發生急性腎功能衰竭而死亡。但大多數預後良好。
其他
腮腺炎的其他併發症發生率約佔5%～10%，常見的有乳腺炎、骨髓炎、肝炎、肺炎、前列腺炎、前庭大腺炎、甲狀腺炎、胸腺炎、血小板減少、蕁麻疹、淚腺炎等，急性皰疹性結膜炎等均少見。關節炎多發生在腮腺腫大1～2周之內，主要累及肘、膝等大關節，可持續2天至3個月不等，能完全恢復。
