系統性紅斑狼瘡不但影響皮膚組織，還可波及到全身其他器官，若波及中樞神經系統後，則稱為狼瘡性腦病，神經系統受到損害是系統性紅斑狼瘡患者主要的死亡誘因。系統性紅斑狼瘡患者中樞神經系統受到損害的主要表現有以下6個方面。
1、頭痛：頭痛是系統性紅斑狼瘡患者腦損害最常見的表現，可表現為緊張性、肌收縮性或偏頭痛樣頭痛。
2、癲癇：癲癇最常發生在系統性紅斑狼瘡患者腦損害的晚期，患者常在發病後數天至一個月內死亡。可表現為癲癇大發作、小發作和精神運動性發作等。
3、腦血管病：系統性紅斑狼瘡的中樞系統損害可造成腦血管閉塞，甚至破裂出血，使患者出現偏癱、偏身感覺障礙、視野缺損、失語等症狀。
4、顱內壓增高：系統性紅斑狼瘡導致免疫複合物沉積在腦內小血管中，使血管通透性增加，從而引起顱內壓升高。
5、顱神經麻痺：系統性紅斑狼瘡導致供應顱神經的小血管發生炎症，進而引起顱神經麻痺，使患者出現複視、眼球震顫、上瞼下垂、三叉神經痛、眩暈、視力減退、面部感覺減退等症狀。
6、精神障礙：患者可出現精神病樣反應，如幻聽、幻視、妄想、木僵、恐懼、被控制感等。
