1.活組織檢查 在直視或陰道鏡下對病灶多點活檢，為陰道腺病確診方法。
2.陰道鏡檢查及活檢 通常陰道鏡下可見病灶內有類似子宮頸移行區柱狀上皮變化，塗醋酸後可見典型葡萄狀組織，轉化區內可見鱗狀上皮化生，柱狀上皮島，腺體開口和小的腺囊腫，有時可見白色上皮、白斑、點狀血管、鑲嵌等陰道鏡圖像。在受DES影響而發生陰道腺病中90%陰道鏡檢查可見上述不同圖像。血管徵象通常需綠色濾鏡下仔細觀察，但通常形態沒有明顯改變。病灶區醋酸和碘常不著色。利用陰道鏡檢查診斷陰道腺病有較高的可靠性。
細胞學檢查：直接在可疑病灶表面刮片，或從陰道穹隆部和上、中段陰道黏膜刮片後行細胞學檢查，如發現黏液上皮細胞或鱗化細胞，提示陰道腺病可能。但因多數病灶位於黏膜下，故刮片細胞學檢查結果以陰性為多，且易受陰道炎症影響，對診斷陰道腺病意義有限。但對於隨訪，上皮不典型增生和早期發現惡變不失為簡便經濟的一種手段。
