該疾病惡性程度高，病程短，轉移快，採用單純的手術、放療、單藥化療，效果均不很理想，絕大多數患者在2年內死亡，5年生存率不超過10%。近年來採用綜合療法，使侷限尤文肉瘤治療後5年存活率提高到75%以上。
1.手術治療
以往手術是治療本病的主要措施，隨著放療、化療療效的提高和對其所產生副作用的對策逐漸完善，單純採用外科手術治療的患者日趨減少。但到目前為止，手術截肢或截除仍是本病治療手段之一。手術治療的原則是完全切除腫瘤，以最大限度的達到有效的局部控制，防治和減少腫瘤的轉移。在此基礎上，儘可能多地保留肢體功能，提高患者的生活質量。因此手術治療的作用日趨重要。為了正確地選擇手術方案，術前應對患者進行全面、認真的評價，根據患者的年齡、腫瘤的部位、腫瘤的大小和腫瘤毗鄰的重要解剖組織，決定採用何種手術方式。由於術前大多使用療程不等的化療，因此還需估價腫瘤對化療的臨床反應程度，這往往需要比較化療前後原發病灶的X線片，CT掃描或MRI，以確保手術成功。
2.放療
對放療極為敏感，是治療尤文肉瘤的主要措施。一般給小劑量(3000～4000rad)照射，能使腫瘤迅速縮小，局部疼痛減輕或消失。但單純放療遠期療效很差。
3.化療
目前認為對尤文肉瘤有效的藥物有環磷酰胺、阿黴素、更生黴素、長春新鹼、卡氮芥等。組成的聯合方案也很多，效果較好的為CVD方案 (CTX+VCR+DACT+VCDA)、CVDA方案(在CVD方案的基礎上加ADM)等。因本病大多在2年內發生轉移，故一般主張化療需持續2年。
4.綜合治療
綜合治療係指放療加化療加手術或不加手術的綜合治療方法。其方法選擇有：
(1)放療加化療主要適用於不能施行手術的患者，包括晚期患者，採用中等量或較大劑量的放療加藥物聯合化療。根據患者的具體情況，放療和化療可同時開始或先後應用。
(2)手術切除加中等量放療加化療只要能夠將腫瘤切除，則應切除加中等量的放療加多藥聯合化療。目前也有學者主張先進行聯合化療，待腫瘤明顯縮小，再施行大塊切除，遠端再植或用骨移植，以及人工骨、關節修復缺損。術後原腫瘤所在骨放療3500rad，再加聯合化療。
(3)手術加放療或化療目前此方法應用比較少，只是對放療或化療不能耐受時才採用，且療效不優於放療加化療。
(4)對已播散的治療只要全身情況允許，在給予支持療法的同時，對骨原發灶及轉移灶給予放療加聯合化療。
5.中醫中藥
在放療、化療的同時，根據患者的具體全身情況應用中醫中藥辨證施治，扶正祛邪，制定治療方案，也可取得一定的療效。
