一旦發現孩子出現肉毒桿菌中毒的症狀，家長應攜帶可疑食物立即送孩子去醫院治療。醫院或防疫站通過對可疑食物作細菌學檢查，能協助醫生儘快明確診斷。
如果能在進食汙染食物24小時內或出現肌肉癱瘓前給予特效的抗肉毒免疫血清則效果最好。
在出現中毒症狀後2~8天內，病情多進展迅速，如不及時治療，易發生呼吸或心力衰竭，治療多較困難，常使病程延長甚至引起死亡。另一部分比較幸運的病人在病情發展到一定程度後，可逐漸趨向好轉，呼吸及言語困難等症狀可逐步改善，但視覺功能恢復較遲，甚至可持續數月之久。對已經發生呼吸困難的孩子，輕者通過鼻導管或面罩吸氧後，口唇青紫、呼吸困難就可以逐步糾正;對呼吸肌幾乎完全麻痺的患者，需氣管內插管後使用人工呼吸機來替代患兒的自主呼吸，這樣同時可節省患兒用於呼吸的能量消耗，幫助孩子渡過危險期。作為家長應特別注意的是，即使在病情穩定或恢復期內，如果孩子過度勞累，還可使已經消失的症狀重新出現，嚴重者仍可造成死亡。
