早在石器時代 ，人類已經開始使用咖啡因。早期的人們發現咀嚼特定植物的種子、樹皮或樹葉有減輕疲勞和提神的功效。直到很多年以後，人們才發現使用熱水泡這些植物能夠增加咖啡因的效用。許多文化都有關於遠古時期的人們發現這些植物的神話。
咖啡因根據一個古老的蒙古神話，大約公元前3000年的中國皇帝神農氏，在一次偶然的機會下，發現當有的樹葉飄進沸水中會產生一種芳香且提神的飲品 。一本古老的關於茶的著作陸羽《茶經》中也提到了神農氏的名字。咖啡早期的歷史十分朦朧，不過一個流傳廣泛的神話能讓我們回溯到阿拉伯咖啡的發源地埃塞俄比亞。根據這個神話，一個名叫卡迪的牧羊人發現，當山羊食用了咖啡灌木上的漿果時會變得興奮異常並且在夜裡失眠，山羊也會不斷地再次食用該漿果，體驗相同的活力。最早的有關咖啡的書面記載可能是9世紀波斯醫師al- Razi所著的Bunchum。
1587年，Malaye Jaziri彙編了一本追溯咖啡歷史及合法性爭議的書，名叫《Umdat al safwa fi hill al-qahwa》。在這本書中，Jaziri記錄了一個亞丁的伊斯蘭教長Jamal-al-Din al-Dhabhani是首先於1454年飲用咖啡的人，15世紀後，也門的蘇菲派穆斯林開始有規律的飲用咖啡來保持祈禱時的清醒。16世紀快要結束的時候，在埃及的歐洲居民們記錄了咖啡的使用，大概這個時候，咖啡開始在近東廣泛使用。咖啡最為一種飲料在17世紀流傳到歐洲，最初被稱為阿拉伯酒。這段時間，咖啡屋開始增多，最初的咖啡屋是在君士坦丁堡和威尼斯。在英國，第一家咖啡屋開業於1652年，在倫敦Cornhill街聖邁克爾巷。很快咖啡開始在西歐流行並在17和18世紀社會交流中扮演了重要的角色。
