藥物治療更年期綜合症是一種常見的治療方法，但是對於更年期綜合症患者來說，一個系統科學的治療方案是必須的，但是依靠藥物，不僅會差生依賴有時甚至會引起副作用。比如如今最常見的女性更年期藥物治療應該就是激素治療，而且其在臨床上的應用也越來越廣泛，但由於對更年期藥物治療缺乏認識及存在用藥誤區，很多女性把雌激素當成重返青春的靈丹妙藥，甚至通過自行購買含有雌激素的保養品來延遲更年期或者緩解不適症狀。這種將激素當作保健品來用的做法極其危險的，因為更年期激素治療若使用不當，將會對產生很大的副作用。雌激素不能濫用，不宜補得過早、過多或過急，單純為了保持年輕而補充雌激素更是有害無益。
對於症較重者，應根據不同的症狀恰當採用一些藥物治療。若出現精神，神經方面的症狀如頭痛，頭暈，憂慮，失眠等症狀時，可服安定或眠爾通。這些藥物有鎮靜及穩定神經的作用。亦可服用谷維素10-20毫克，每日3次，有調節植物神經功能的作用。此外，還可服用維生素B、複合維生素B、維生素E及維生素A。上述這些藥物須根據病情適時調整劑量，當症狀減輕或消失後即停藥。這些治療方法及藥物對更年期綜合症均有較好的效果。
如果患者已經確診為是更年期綜合症一定要到正規的醫院接受詳細的檢查，對症治療才治療的關鍵。一些更年期綜合徵的症狀也常常是某些組織性疾病的先兆症狀。因此，認真地進行鑑別診斷是十分重要的。
