雖然左旋肉鹼被認為是沒有副作用的安全減肥補給品，但並不意味著可以長期服用，也不意味著任何群體都能服用，要避免左旋肉鹼的危害發生，則需要注意服用人群，如無必要，不建議將其作為日常保健品服用。
左旋肉鹼適用於想要減肥瘦身、不喜歡有大量運動的人，要注意的是，雖然左旋肉鹼本身沒有副作用，但是一部分人長期攝取用以減肥，而使用了假冒的左旋肉鹼的話，則可能會出現不減反增，在身體留下傷害的效果。所以，為了避免這些副作用的發生，一定要選購正規的產品。
另外，如果服用過量的左旋肉鹼後，部分人會出現輕度腹瀉的現象，在一般左旋肉鹼減肥產品中，初次服用後，有部分的人會出現輕微頭暈旋以及口渴。
