在病區建立和健全防治機構，培訓農村醫師，進行長年綜合預防，通過病情監測，發現早期病人及時給予治療。口服亞硒酸鈉(Na2SeO3)片對預防本病有效。通常每10天口服1次，成人每次 4mg。應堅持長年服藥，但在非發病季節，可停藥3個月。脫貧致富，提高病區人民生活水平，亦是重要的預防對策。
1.改善膳食結構 科研人員瞭解到食物組成不同，患病率有明顯差異。克山病患者飲食中豆類、蔬菜、動物性食物、油脂等均較低，維生素A、維生素B12及硒的攝入量尤其低，食物中鈣的含量也明顯不足。觀察結果證實改善膳食有明顯的防病作用。提出改變或改善病區居民膳食組成，合理安排食物供給，居民營養合理化，將能控制克山病的發生。
2.注意休息及加強管理 根據患者的心功能狀態，限制或避免體力和腦力活動，提倡生活規律，勞逸結合。休息能減輕心臟負擔，促進損傷心肌恢復。避免上呼吸道感染及精神刺激。病情不穩定者應加強隨訪觀察。
