(一)餵養不當
長期攝食不足，如母乳不足又未能及早添加輔食;人工餵養者，食物的質和量未能滿足需要，如乳類稀釋過度，或單純用澱粉類食品餵哺;突然斷奶，嬰兒不能適應新的食品等。
(二)飲食習慣不良
飲食不定時、偏食、反芻習慣或神經嘔吐等。
(三)疾病因素
疾病影響食慾，妨礙食物的消化、吸收和利用，並增加機體的消耗。易引起營養不良的常見疾病有：遷延性嬰兒腹瀉、慢性腸炎或痢疾、各種酶缺乏所致的吸收不良綜合徵、腸寄生蟲病、結核病、麻疹、反覆呼吸道感染、慢性尿路感染等，某些消化道先天畸形(如唇裂、顎裂、先天性肥大性幽門狹窄或賁門鬆弛等)和嚴重的先天性心臟病均可致餵養困難：某些遺傳性代謝障礙和免疫缺陷病也可影響食物的消化、吸收和利用。
早產和雙胎易引起營養不良，宮內感染，孕母疾病或營養低下，胎盤和臍帶結構與功能異常均可導致胎兒營養不足和宮內生長阻滯，為嬰兒營養不良的先決條件。
重度營養不良大多由於多種因素所致。
