本病與其他部位急性骨髓炎相同，除應用有效廣譜抗生素外，早期開窗引流，減低骨內壓以防感染擴展。對病灶輕輕刮除，不可用力搔爬，否則會過多損傷骨松質，並形成較大骨腔，或使病灶擴大。跟骨為人體負重單元，故術後不宜過早活動，待新骨形成後方可負重行走。
跟骨骨髓炎採用常規的足部切口及手術方法，療法常不滿意，足內側或外側切口僅用於軟組織膿腫，或跟骨急性骨髓炎“開窗”引流。而在慢性跟骨骨髓炎應採用特殊的足跟蹠面切口。通常在足蹠面作切口是禁忌的，這是因為足底瘢痕可引起負重時疼痛，而採用Gaenslen切口顯露，即在足底跟部確切的正中線作一縱行切口。起自第五蹠骨基底水平，向後直至跟腱遠端，縱行劈開跟骨，清除病灶。如此治療跟骨難以治癒的跟骨慢性骨髓炎，不僅引流十分充分，治癒率高，而傷口癒合後，兩側皮瓣內翻，並形成跟墊，負重時沒有疼痛。即便偶爾出現跟部蹠面不平，通過墊鞋墊，一般不會影響走路。
