涎石形成的原因還不十分清楚，有多種學說。涎石多發於下頜下腺於下列因素有關;下頜下腺為混合性腺體，分泌的涎液富含黏蛋白，較腮腺分泌也黏滯，鈣的含量也高出2倍，鈣鹽容易沉積; 頜下腺導管自下向上走行，腺體分泌液逆重力方向流動，導管長，在口底後部有一彎曲部，導管全程較曲折，這些解剖結構均使涎液易於淤滯，導致涎石形成。
此外，下頜下腺結石可能與下列因素有一定關聯： 全身因素：有研究證明在134個病例當中，下頜下腺結石症的臨床分析結果顯示，合併全身其他部位結石症者8例，佔6%，這一比例顯然高於一般人群結石症的發病率。其中膽結石6例，腎盂或輸尿管結石2例，表明患者的體制狀態，即全身的鈣磷代謝異常可能參與下頜下腺結石症的發病;舌繫帶過短：3例患者伴有舌繫帶過短，附著靠前。舌繫帶過短影響舌體自如運動，不利於口腔清潔，又有可能使涎液流動狀態改變，涎液中的礦物質易於沉積而發生結石;134例中有1例患者伴有下頜淋巴結上皮病。下頜下腺分泌能力降低，可導致腺內多量微結石形成，後者沉積擴大，可發展為涎石症。
總之，下頜下腺結石形成的原因很多，不同病例可能有不同的直接原因，多種因素共同作用下形成下頜下腺結石。
