西醫治療：
西醫治療腳氣能夠明確診斷出是哪一種真菌致病的，如通過局部真菌的顯微鏡下檢查，或選擇真菌培養試驗，查清致病菌後，採用針對這種真菌的口服抗真菌藥或局部抗真菌藥膏。
症狀輕的只需用外擦藥膏，症狀嚴重或長期反覆的需要在此基礎上加服口服藥。不過，西藥口服抗真菌藥對肝功能有影響，不適合肝功能損害者和乙肝患者。
中醫治療：
中醫認為腳氣是“腳溼氣”，治療上主要採用清熱利溼的藥物外洗，較少用口服藥。症狀輕的患者可以自己到藥店購買中藥煲水，腳泡十五分鐘左右後把腳擦乾，尤其是腳趾縫。
中藥要自己煮，比較麻煩，不過，目前也有不少治療腳氣的外用膏藥如足淨膏可供選擇。另外，患者要注意，泡腳的藥物如果刺激性強，或者含有酒精的，不要用來泡已經有明顯糜爛的腳，也不要用來擦臉上和陰部這些皮膚薄的地方，否則容易損傷皮膚，導致潰爛。
與西藥相比，中藥配方研製的外用膏藥，不僅可以殺真菌，還可以殺細菌等，起到治療和保健的作用，相對西藥作用比較全面。
