肛門疼痛主要是指肛門內以及肛門直腸周圍疼痛為主的一種症狀，為多種肛門直腸疾病所共有。如肛裂、肛竇炎、血栓性外痔、肛旁膿腫、內痔嵌頓、外痔水腫、肛管直腸癌以及肛門異物損傷、肛門直腸手術後等。而其疼痛的性質、程度以及伴隨症狀各有所異。
（1）肛裂
引起的疼痛，呈週期性，多發於大便時或大便後，主要由糞便刺激，潰瘍裂口擴張所致。其疼痛為陣發性灼痛或刀割樣疼痛，可持續數分鐘；待糞便通過後，疼痛減輕。另外，由於排便的刺激，內括約肌可呈持續性痙攣，引起潰瘍裂口劇烈而持久的疼痛；往往可持續數小時之久，患者坐臥不安，十分痛苦；嚴重者可疼痛24小時以上。除了疼痛，肛裂者常伴有出血、便秘等症狀。
（2）肛竇炎
一般為肛門部微痛、墜脹，排便時因糞便壓迫發炎的肛竇而致肛門部灼痛，若括約肌因受刺激而攣縮，疼痛則加劇，並向臀部及股後部放射。常伴有少量膿性或粘液性分泌物外溢、氣味臭，日久可致肛周潮溼、瘙癢等不適。
（3）血栓性外痔
輕者有異物感，大多伴有脹痛。由於肛周靜脈血管破損，血塊凝結而成血栓，在肛門外皮下出現青紫圓形硬結節，一般在截石位3點、9點處。
（4）肛旁膿腫
以脹痛為主，釀膿時疼痛呈雞啄樣。由於肛旁膿腫的發生部位、膿腫大小、致病菌和患者機體抵抗力等種種因素不同，出現的症狀和體徵也各有異。常見的有肛門周圍皮下膿腫、坐骨直腸窩膿腫、骨盆直腸窩膿腫、直腸後膿腫，以及結核性膿腫等。這些膿腫除主要症狀有所不同外，一般均半有發熱、寒戰、便秘、排尿不暢等。與其他部位不同的是約90％以上的肛旁膿腫可形成肛瘻，病程較長。
（5）內痔嵌頓
以脹痛、灼痛為主，多由於痔靜脈曲張、血絡破損、血栓形成，造成組織循環受限而脫出肛門外，無法回納，好發於Ⅱ、Ⅲ期內痔。故需儘早回納或手術治療，否則表面粘膜極易出血、破損，甚至併發感染。
（6）外痔水腫
以墜脹、灼痛為主，表現為肛門邊緣侷限性腫塊，質硬、光滑、晶亮、觸痛明顯。多由於勞累，大便時努掙或手術刺激等造成。
（7）直腸癌
早期無疼痛，以後由於腫塊增大破潰，可出現肛門部墜脹、隱痛，常見有大便習慣改變、膿血便、腹脹、腹痛、消瘦等症狀。患者若有上述症狀，要及時請專科醫生診斷、治療。
（8）肛門異物損傷
多為外傷異物殘留或飲食不當，魚刺、骨片嵌插肛管直腸所致，故需請醫生仔細檢查，取出異物，疼痛即能緩解。若滯留時間過長，可引起局部感染。
（9）肛門直腸神經官能症
陰部神經症候群、直腸炎症等均可引起肛門直腸疼痛，臨床上常需注意，加以鑑別。
以上（1）、（2）、（5）、（6）多為排便時疼痛；（3）、（4）、（7）、（8）多為持續性疼痛；（9）為間隙性疼痛。肛門疼痛是最常見的症狀之一，故要明確診斷，尋找致病原因，審因施治。否則非但不能解除痛苦，還將延誤治療。
