診斷小肝癌時注意與以下疾病鑑別：
1.與肝硬化再生結節鑑別 肝硬化再生結節常數目較多.在肝內瀰漫分佈，內回聲均勻。此外.短期內複查，動態觀察有助於兩者的鑑別診斷，肝癌生長速度快，而肝硬化再生結節變化較小，必要時可行超聲引導下穿刺活檢，以明確診斷。
2.與小血管瘤鑑別 小血管瘤多為高回聲.內呈網格樣改變.界清.邊緣見回聲增強帶，後方回聲增強明顯，多數無血流顯示，少數有斑點狀血流，較少檢測出動脈型血流。
3.與局灶性結節性增生鑑別 局灶性結節性增生可見中央高回聲的纖維瘢痕向外周呈放射狀延伸，多普勒有時可觀察到特徵性的放射狀血流信號。鑑別有困難時，可行超聲引導下穿刺活檢，局灶性結節性增生是由正常肝細胞、膽管、增生的纖維組織及炎性細胞組成，超聲造影典型表現呈離心性增強。
4.與小肝腺瘤鑑別 小肝腺瘤多見於育齡女性，多有口服避孕藥病史。超聲表現為均勻低迴聲或稍高回聲。界清，周邊可見稍高回聲環繞。內多無血流信號顯示。超聲造影典型表現為向心性的增強。
