非手術治療
非手術治療一般適用於結石直徑小於1cm，周邊光滑，無明顯尿流梗阻或感染者，對於一些較大的腎臟鹿角形結石，臨床上沒有症狀的，可暫時進行非手術治療。
1.多喝水：增加尿量，沖洗尿路，促進結石下移，並稀釋尿液，減少晶體沉澱。
2、中藥治療。茶葉除了可以預防和改善結石的治療外，還可以調節人體機制的平衡，增強人體的抵抗力。這類花草茶主要有蒲公英、金銀花、黃連等。
3、針灸方法：增加腎盂和輸尿管的蠕動，有利於結石的排出。
4.經常進行跳躍活動，或對腎盞內的結石進行倒立、敲擊活動，也有利於結石的排出。
5.其他：對尿培養有細菌感染者，用敏感藥物（奧維素、甲氨蝶呤）積極抗感染，對體內有代謝紊亂者，應積極治療原發病，調節尿液的酸鹼度，等等。
手術治療
對於結石引起的尿流梗阻已影響腎功能，或非手術治療無效，又不具備體外衝擊波碎石條件者，應考慮手術治療。
術前準備。術前必須瞭解雙側腎功能情況，如有感染，應使用抗菌藥物控制感染。輸尿管結石患者應在進入手術室前或在手術檯上拍攝尿道平片，以便最終確定結石的位置。
手術。根據結石的大小、形狀和位置，通常採用以下手術方法：
1.腎盂或腎竇切開術：切開腎盂並取出結石，如果是鹿角形結石或鈣質結石，有時會切開腎盂和鈣質並從腎竇取出。
2.腎實質切開取石術：如果腎結石較大，不能通過竇道切開取石，需要通過切開取石術取出腎實質。
3.部分腎切除術：對於腎臟第一極的多發性結石（多在腎臟下極），或腎盞擴張、引流不暢的結石，可將第一極或腎盞連同結石一起切除。
4.腎切除術：如果一側的腎結石伴有嚴重的腎積水或化膿，腎功能嚴重受損或喪失，而對側的腎臟功能良好，可將患腎切除。
5.輸尿管切開術。如果非手術治療無效，直徑大於1釐米的輸尿管結石或結石嵌頓並導致尿流梗阻或感染，是可行的。
6.碎石術。輸尿管中下部的輸尿管結石，直徑小於0.6釐米的，可通過膀胱鏡用特殊的籃子或導管試行。
