門靜脈血栓形成的病因很複雜，主要有炎症性 腫瘤性 凝血功能障礙性 腹腔手術後 外傷性及原因不明性等。25％～30％的成人門靜脈血栓病例繼發於肝硬化。嬰幼兒門靜脈血栓多繼發於先天性門靜脈閉鎖、臍靜脈膿毒血癥、闌尾炎等。PT可分為原發性與繼發性兩種健康搜索。原發性多與血液高凝狀態有關。國外報道372例繼發性腸繫膜靜脈血栓形成患者，發現周圍靜脈炎、腹腔炎症性疾病 腹部大手術與門靜脈高壓健康搜索是發生的主要因素 且以脾切除術後為常見。局部因素在PT形成的危險因素中佔40％ 局部因素的存在促進了門靜脈血栓的形成健康搜索，這些局部因素主要分4類：局部感染灶、門靜脈系統損傷、腹腔腫瘤和肝硬化 臨床上以肝硬化伴發PT為最多。PT還可見於妊娠（特別是子癇患者） 口服避孕藥和引起門靜脈淤血的患者（如肝靜脈阻塞、慢性心力衰竭、縮窄性心包炎） 有學者認為至少有1/3的PT患者火罐網是多種危險因素聯合作用的結果。
1、門靜脈高壓症
多因各種病因的肝硬化及充血性脾大所致。主要是由於門靜脈壓力升高，造成門靜脈及其屬支的向肝性血流的減少和血流速度的減慢造成渦流而致血小板堆積形成血栓。
2、腹腔感染
為腸道感染性病灶的細菌進入門靜脈系統所引起，如新生兒臍炎、臍靜脈膿毒血癥 成人常見的有急性闌尾炎、胰腺炎、膽囊炎、空腔臟器的穿孔、小腸炎性病變腹腔盆腔膿腫及腹部術後感染等。
3、腹部手術及外傷
各種腹腔的手術均可導致門靜脈系統的血栓形成，特別是脾切除術後最常見可能與術後血小板增多和血液黏稠度升高有關。脾切除術後門靜脈血流量減少，門靜脈壓力下降加速了血栓的形成。此外術後擴張的脾靜脈內血流緩慢，在高凝狀態下又促成了脾靜脈血栓形成。
4、血液處於高凝狀態
腹部腫瘤火罐網特別是結腸及胰腺的腫瘤，常伴有門靜脈系統的高凝狀態，可導致血栓形成。近年來還發現遺傳性凝血功能紊亂也參與門靜脈血栓的形成，包括蛋白C、蛋白S和抗凝血酶缺陷等。
5、腫瘤等壓迫門靜脈
腫瘤(如胰腺腫瘤、肝細胞癌)壓迫、腸扭轉等導致門靜脈系統血流受阻，致門靜脈血栓形成。
6、其他原因
包括原發性小靜脈硬化、脾靜脈或腸繫膜靜脈血栓的蔓延、部分患者有長期服用避孕藥史，少見的因素有各種充血性心力衰竭、紅細胞增多症等。
7、原發性門靜脈血栓形成
少部分肝外門靜脈栓塞尚無明確病因。可有四肢深靜脈血栓形成或遊走行血栓性靜脈炎病史。
