1、腦膜炎或腦膜腦炎：發病率5～25%，局部地區可達35%。一般認為系該病毒直接侵入中樞神經系統所引起。腮腺腫前6天或腫後2周內出現，一般多在1周內發生。臨床表現為急性高熱伴劇烈頭痛、嘔吐、嗜睡或意識障礙，腦膜刺激徵陽性等，腦脊液檢查均呈病毒性腦炎或腦膜炎的改變。一般預後良好，個別重者可致死亡。
2、耳聾：表現為嘔吐、旋暈、耳鳴等症狀，主要是由內淋巴迷路炎及聽神經炎所致。雖然發病率很低(約1/15，000)，但可成為永久性和完全性耳聾，所幸多發生於單側(75%)，故仍能保留一定的聽力。
3、心肌炎：約4～5%患者發生心肌炎，多見於病程5～10天。表現為面色蒼白，心率增快或緩慢，心音低鈍，心律不齊，暫時性心臟擴大。收縮期雜音。心電圖可見竇性停搏，房室傳導阻滯、ST段壓低、T波低平或倒置等。嚴重者可致死。但多數僅有心電圖改變而無明顯臨床病狀。偶有心包炎。
4、腎炎：早期尿中可分離出腮腺炎病毒，故認為腮腺炎病毒可直接損害腎臟，輕者尿中有少量蛋白，重症與急性腎小球腎炎的表現相同，個別嚴重者可發生急性腎功能衰竭而死亡。但大多數預後良好。
