腫瘤標記物的測定可以作為普查的內容之一(目前個人體檢項目中經常包括),對腫瘤的診斷有一定的參考價值。同時還能觀察腫瘤的治療效果,監測復發、轉移及判斷預後。
常用的消化道腫瘤標記物有CEA(癌胚抗原)、CA199、CA125、CA50、CA242、CA724。臨床上懷疑食管癌的患者首選檢測CA199,其次可選CEA。懷疑胃癌的患者首選檢測CEA和CA724,其次可選CA199和CA242。懷疑結腸癌的患者首選檢測CEA,其次可檢測CA199,CA125及CA242。上述標記物單一異常往往缺乏明確的特異性,多個標記物同時出現明顯增高的臨床意義更大一些,但也只能作為臨床診斷的參考。