內痔出血應與下列疾病相鑑別：
1、直腸癌。本病可能有肛門墜脹不適感，並有便血史，但便血為黏液血便，且與大便相混，為暗紅或果醬色。多數直腸癌在指診時，在齒線上可摸到直腸管壁上質地較硬、邊緣不整齊、活動性差、並向腸腔突出的腫物，肛門直腸鏡檢查可見突出的腫物，多呈菜花狀，伴有潰瘍或出血，取活體作病理學檢查，即可確診。
2、低位直腸息肉。直腸良性腫瘤，多見於兒童，主要症狀也是無痛性便血，低位帶蒂息肉可脫出肛門外，如一帶柄的“紅櫻桃”。可予電灼或套扎切除，預後良好。
3、 肛裂。便血伴有劇烈肛痛是其特點，並多有 便秘
史，而內痔便血時一般不痛。查肛可見肛緣前方或後方有縱行破裂口或潰瘍，而裂口遠端有增生的結締組織性外痔，猶如肛裂的“哨兵”，常被形象地稱為“前哨痔”。
4、直腸脫垂。易誤診為混合痔，但直腸指檢時發現有括約肌鬆弛，俗稱“脫肛”。
5、肛乳頭肥大。位於齒狀線上，錐形，表面呈白色，不常出血。
6、下消化道出血。臨床頗易誤認為痔出血，需加以鑑別。痔出血特點是隨糞便滴血或射血，血色鮮紅，與糞便不混合;下消化道出血原因眾多，有炎性、腫瘤性等，出血多為膿血或粘液血便或伴有壞死組織，與糞便混合。確診需行乙狀結腸鏡檢，糞便致病菌培養，鋇劑灌腸雙重造影等。
