蜈蚣具有息风镇痉，攻毒散结，通络止痛的作用。主要用于小儿惊风，抽搐痉挛，中风口，半身不遂，破伤风，风湿顽痹，疮疡，瘰疬，毒蛇咬伤等证。
现代临床上还用于治疗结核病(结核性胸膜炎、结核性肋膜炎、肺结核、散发性结核、骨结核、乳腺结核及颈淋巴结核等)，癌症(食道癌、乳腺癌、皮肤癌、肺癌、子宫癌、唇腺癌等)。
1.痉挛抽搐。本品性温，性善走窜，通达内外，搜风定搐力强，与全蝎均为息风要药，两药常同用，治疗各种原因引起的痉挛抽搐，如止痉散(《经验方》);若治小儿口撮，手足抽搐，以本品配全蝎、钩藤、僵蚕等，如撮风散(《证治准绳》)，又(《圣惠方》)万金散，治小儿急惊，以本品配丹砂、轻粉等分研末，乳汁下;若治破伤风，角弓反张，即以本品为主药，配伍南星、防风等同用。如蜈蚣星风散(《医宗金鉴》)。经适当配伍，本品亦可用于癫痫、风中经络，口眼斜等证。
2.疮疡肿毒，瘰疬结核。本品以毒攻毒，味辛散结，同雄黄、猪胆汁配伍制膏，外敷恶疮肿毒，效果颇佳，如不二散(《拔萃方》);本品与茶叶共为细末，敷治瘰疬溃烂，如《本草纲目》引《枕中方》验方，新方结核散，配合全蝎、土鳖虫，共研细末内服，治骨结核;若以本品焙黄，研细末，开水送服，或与黄连、大黄、生甘草等同用，又可治毒蛇咬伤。
3.风湿顽痹。本品有良好的通络止痛功效，而与全蝎相似，故二药常与防风、独活、威灵仙等祛风、除湿、通络药物同用，以治风湿痹痛、游走不定、痛势剧烈者。4.顽固性头痛。本品搜风，通络止痛，可用治久治不愈之顽固性头痛或偏正头痛，多与天麻、川芎、白僵蚕等同用。
