手术途径包括：经阴道、经腹和经腹-阴道联合途径。瘘管的部位是选择手术途径的最重要依据。膀胱的输尿管脊是边界，瘘管位于膀胱后三角区的输尿管脊上方。膀胱三角区、膀胱颈和输尿管脊以下的尿道采用经阴道途径。对于难以通过单一经腹或经阴道途径修复的复杂尿道瘘，可以选择经腹-阴道联合途径。现在，腹腔镜经腹途径也可用于修复膀胱阴道瘘。
经阴道途径是一种可重复的途径，对病人的创伤较小，恢复时间较短，可同时进行对抗尿失禁或纠正脱垂，如果修复失败，可再进行经腹部手术。经腹途径简单，成功率高，但术后恢复时间较长。瘘管周围有广泛瘢痕组织的患者、膀胱容量小或顺应性低需要在术中同时扩大膀胱的患者、需要在术中同时进行输尿管移植的患者、尿道瘘管涉及盆腔内其他结构的复杂患者、以及合并阴道狭窄的瘘孔难以暴露的患者。
由于膀胱阴道瘘修复涉及泌尿外科和妇科，只有通过培训专门从事盆腔矫形外科的医生才能提高瘘管修复的成功率。
