(一)血象：急性病例白細胞總數及中性粒細胞有中等度升高，慢性病人可有輕度貧血。
(二)糞便檢查：典型痢疾糞便中無糞質，量少，呈鮮紅粘凍狀，無臭味，鏡檢可見大量膿細胞及紅細胞，並有巨噬細胞，培養可檢出致病菌，如採樣不當，標本擱置過久，或患者已接受抗菌治療，則培養結果常不理想，常用的鑑別培養基為SS瓊脂和麥康凱瓊脂。
(三)其他檢查：熒光抗體染色技術為快速檢查方法之一，較細胞培養靈敏，國內採用免疫熒光菌球法，方法簡便，靈敏性及特異性均高，採樣後8小時即可作出診斷，且細菌可繼續培養並作藥敏試驗，乙狀結腸鏡檢查可見急性期腸粘膜瀰漫性充血，水腫，大量滲出，有淺表潰瘍，有時有假膜形成，慢性期的腸粘膜呈顆粒狀，可見潰瘍或息肉形成，自病變部位刮取分泌物作培養，可提高檢出率，此外，X線鋇劑檢查在慢性期患者，可見腸道痙攣，動力改變，袋形消失，腸腔狹窄，腸粘膜增厚，或呈節段狀，近年來有人以葡萄球菌協同凝集試驗作為菌痢的快速診斷手段，具有良好的敏感性和特異性。
