多項研究表明，轉基因食品對哺乳動物的免疫功能有損害。且試驗用倉鼠食用了轉基因食品後，到第三代，就絕種了。長期食用轉基因的食物，對身體的傷害是很大的，甚至影響人的基因的，要儘量避免食用，但是少量的食用影響不大。
1、產生毒素或增加食品毒素含量。一些研究學者認為，轉基因食品可能增加微量毒素的含量，嚴重的會導致某些遺傳類疾病。
2、營養成分減少。英國倫理和毒性中心的試驗報告說，轉基因食品中對人體有益的成份減少了12%至14%。
3、引起人體過敏反應，造成不可預知的後果。而天然食品卻不存在以上的缺點，對人體是相對安全的。
