蠅蛆病的主要症狀表現在蠅蛆對宿主或患者的機械刺激。蠅蛆身體表面的毛，鉤，刺，移行等會刺激宿主的體壁。患者會感到身體裡某部位有刺，痛，癢，異物感，移行感等。比如鼻蛆病患者會打噴嚏，鼻內異物感。泌尿生殖道蠅蛆病患者會感到下腹，尿道，陰道內有刺痛感，移行感，尿頻，尿急，尿痛等。皮蛆病患者會感到皮下錐痛，皮下有移行感，皮下甚至可見蠅蛆移行後留下的隧道。另外蠅蛆體表帶有細菌，可能引起感染。引起鼻蛆病的蠅蛆可能會通過鼻竇進入顱腔，造成嚴重後果，甚至引起死亡。引起眼蠅蛆病的蠅蛆可能會進入眼球內部，破壞眼內組織，造成失明。一些蠅蛆會以宿主身體組織為食，如螺旋錐蠅的蠅蛆。造成的後果嚴重，甚至是死亡。
(1)匐行疹 當蠅蛆穿過皮膚,在皮下組織移行時,皮膚上出現紅色的水腫性隆起,幼蟲即隱藏在水皰前端的正常皮膚內。
(2)癤腫型 初發時在皮膚上出現大小不等,深淺不一的結節或腫塊,伴有疼痛和壓痛,蠅蛆就生存地結節內,當幼蟲快要鑽出皮膚時,腫塊逐漸增大,局部水腫加劇,皮面毛孔擴張,有錐刺樣的疼痛及蟲體蠕動感,幾小時後腫塊或結節表面出現黃豆大水皰,皰壁薄而緊張,若刺破皰壁可以從黃紅色粘液中擠出幼蟲,隨後腫塊縮小,炎症也隨之消退,中心留下一個穿鑿性小孔而愈.若蠅蛆寄生的部位很深,結節需數月才能破潰,這種情況少見.若結節不破潰,蠅蛆可在皮下潛行數釐米後又重新出現新的結節或腫塊,在腫塊表面出現小丘疹,形成假性膿腫,此型稱變異性皮膚蠅蛆病.癤腫型皮膚蠅蛆病多發生於皮膚鬆弛部位,多見於眼瞼,口唇,腹,前臂深處,數目1～2個或多達10餘個。
