糞鏈球菌菌形圓或橢圓,可順鏈的方向延長,直徑0.5-1.0微米,大多數成雙或短鏈狀排列,通常不運動。在豐富培養基上菌落大而光滑,直徑1-2mm,全緣,罕見色素。其營養要求低,在普通營養瓊脂上也可生長。能在10℃或45℃ pH 9.6或含6.5%NaCl肉湯培養基中生長,並能耐65℃ 30分鐘。它可利用精氨酸為能源,發酵山梨醇,不發酵阿拉伯糖。在簡單的培養基上生長不需葉酸。
近年來,DNA-DNA雜交結果顯示,腸球菌與鏈球菌屬同源程度低,故有學者建議另立腸球菌屬,與人類有關者為糞腸球菌(E.faecalis)和屎腸球菌(E.faecium)。