雖然鮮黃花菜中含有有毒的秋水仙鹼，但幹黃花菜是經過蒸熟曬乾的，秋水仙鹼已經受熱被破壞了，不會引起中毒。但是，這並不說明幹黃花菜沒有毒，因為為了讓幹黃花菜有賣相、能長期保存，不良商家會用硫磺熏製。
據業內人士介紹，鮮黃花菜在製成乾菜的過程中，為了能夠讓顏色漂亮，延長保質期，有些商家使用了二氧化硫來燻黃花菜。正常情況下，殘留的二氧化硫不會對人體不會造成任何傷害，但目前流通領域內銷售的幾種幹黃花菜中殘留的二氧化硫嚴重超標，這些過量的二氧化硫可能會損傷食道、呼吸系統，重者致死。
專家建議，即使是食用幹黃花菜時，在食用前也最好用清水浸泡至少30分鐘以上，其間多換幾次清水，然後反覆沖洗乾淨後再食用，以去掉殘留的二氧化硫，這樣才能更加安全。此外，烹調時還要加幾滴醋，多熱炒或多燉幾分鐘。這樣，即使略有二氧化硫殘留，在酸性條件下也會較快分解，可以放心食用。
