1、膽汁酸是腸道的一個重要的化學屏障
當水產動物發生細菌性疾病時，會使用抗生素防治疾病，細菌被抗生素殺滅後會產生大量的內毒素。腸道是機體最大的內毒素池，內毒素可引起腸道粘膜水腫，腸絨毛頂部細胞壞死，腸通透性增加，從而破壞腸粘膜屏障功能，在腸粘膜屏障遭到破壞時，內毒素可通過腸粘膜屏障經門靜脈計入肝臟，危害魚體健康。
膽汁酸對內毒素是一個重要的化學屏障：①腸道內的膽汁酸可通過與內毒素的結合而阻止其從腸道吸收入門靜脈，②膽汁酸為去汙劑，已證明兩者在體外對內毒素脂多糖具有直接作用，而且膽汁酸可在試管內改變大腸桿菌內毒素，使其不再引起裂物凝聚，其機制可能為將內毒素分解成無毒性的亞單位或形成微聚物。因此膽汁酸可以減少內毒素對腸道、肝臟乃至整個魚體的危害。
2、膽汁酸增強腸道消化酶活性
膽汁酸能提高脂肪顆粒的比表面積，有利於脂肪顆粒與酶結合，而且膽汁酸具有特殊的生物活性，可以被腸上皮細胞識別，反饋性調節膽汁的分泌，並且能與脂肪酸形成脂肪酸—膽汁酸複合物，改變脂肪酶的性質，提高脂肪酶活性(Baue，2005)。膽汁酸也可提高腸道內容物胰蛋白酶和糜蛋白酶活性，這可能是由於添加的膽汁酸經肝腸循環吸收人肝後，促進了膽汁的分泌，從而增加了腸道消化酶的含量，膽汁中的HCO3—可以調節腸道內的酸鹼度，提供各種消化酶作用的適宜pH值，使消化酶活性增強(趙曉芳，2007)。
3、膽汁酸抑制腸道細菌的過度增殖，維護腸道微生態環境
膽汁酸的缺失將會引發細菌在動物小腸內過度生長，從而與宿主競爭營養，導致宿主對營養的吸收障礙。由於膽汁酸的表面活性劑活性，脫氧膽酸可以破壞細菌的細胞膜，使細胞完整性受損，進而抑制菌的生長，甚至造成細菌細胞死亡。外源補充膽汁酸增加了膽汁分泌，使腸肝循環中膽汁池容量增加，肝臟膽汁酸分泌速度恢復至正常水平，使腸腔內結合膽汁酸的濃度提高，腸腔內結合膽汁酸對小腸內細菌的抑制作用增強，從而抑制腸道細菌過度生長，降低細菌移位和內毒素血癥的發生率。
