先天性巨痣需要及早治療主要有以下幾個原因：
①先天性巨痣的痣細胞會隨年齡的增長由淺層皮膚組織向深層遷移，故年齡越小，痣細胞所處的位置越表淺，治療效果越好;年齡越大，痣細胞越會向深處皮膚組織浸潤，治療時所需去除的組織越多，即損失越大。
②多數先天性黑痣患者的病變絕對面積會隨著年齡的增長而增大，故年齡增大後會增加所需去除病變的面積，增加了治療的難度，降低了治療的效果。
③黑痣是良性病變，其自然病程十分穩定，惡變在黑痣的病程中是極為罕見的;但先天性巨痣存在著較高的惡變率，有國內學者統計為1%～20%，也有國外學者統計為1.2%～42%。不管哪個具體數據準確，總之先天性黑痣必須及早治療，以防止其發生惡變。
