急性闌尾炎臨床誤診率相當高，國內統計為4-5%，國外報道德規範高達30%。需要與急性闌尾炎鑑別的疾病很多，其中最主要的有下列十幾種疾病。
一、與內科急腹症的鑑別：
1、右下肺炎和胸膜炎：右下肺和胸腔的炎性病變，可反射性引起右下腹痛，有進可誤診為急性闌尾炎。但肺炎及胸膜炎常常有咳嗽，咳痰及胸痛等明顯的呼吸道症狀，胸部體徵如呼吸音改變及溼羅音等。腹部體徵不明顯，右下腹壓痛多不存在。胸部X線，可明確診斷。
2、急性腸繫膜淋巴結炎：多見於兒童，常繼發於上呼吸道感染之後。由於小腸繫膜淋巴結廣泛腫大，迴腸未端尤為明顯，臨床上可表現為右下腹痛及壓痛，類似急性闌尾炎。但本病伴有高燒，腹痛壓痛較為廣泛，有時尚可觸到腫大的淋巴結。
3、侷限性迴腸炎：病變主要發生在迴腸末端，為一種非特異性炎症，20-30歲的青年人較多見。本病急性期時，病變處的腸管充血，水腫並有滲出，刺激右下腹壁層腹膜，出現腹痛及壓痛，類似急性闌尾炎。位置侷限於迴腸，無轉移性腹痛的特點，腹部體徵也較廣泛，有時可觸到腫大之腸管。另外，病人可伴有腹瀉，大便檢查有明顯的異常成分。
二、與婦產科急腹症的鑑別：
1、右側輸卵管妊娠：右側宮外孕破裂後，腹腔內出血刺激右下腹壁層腹膜，可出現急性闌尾炎的臨床特點。但宮外孕常有停經及早孕史，而且發病前可有陰道出血。病人繼腹痛後有會陰和肛門部腫脹感，同時有內出血及出血性休克現象。婦科檢查可見陰道內有血液，子宮稍大伴觸痛，右側附件腫大和後穹窿穿刺有血等陽性體徵。
2、卵巢囊腫扭轉：右側卵巢囊腫蒂扭轉後，囊腫循環障礙、壞死、血性滲出，引起右腹部的炎症，與闌尾炎相似。但本病常有盆腔包塊史，且發病突然，為陣發性絞痛，可伴輕度休克症狀。婦科檢查時能觸到囊性包塊，並有觸痛，腹部B超證實右下腹有囊性包塊存在。
3、卵巢濾泡破裂：多發生於未婚女青年，常在月經後兩週發病，因腹腔內出血，引起右下腹痛。本病右下腹局部體徵較輕，診斷性腹腔穿刺可抽出血性滲出。
4、急性附件炎：右側輸卵管急性炎症可引起與急性闌尾炎相似的症狀和體徵。但輸卵管炎多發生於已婚婦女，有白帶過多史，發病多在月經來潮之前。雖有右下腹痛，但無典型的轉移性，而且腹部壓痛部位較低，幾乎靠近恥骨處。婦科檢查可見陰道有膿性分泌物，子宮兩側觸痛明顯，右側附件有觸痛性腫物。
