腎上腺囊腫大多為良性，極少具有內分泌功能，其處理方法主要依據患者的症狀、囊腫的大小以及病理改變而定。
1、對於<3cm，無臨床症狀，無內分泌功能的囊腫可不予治療。
2、對於有腫塊壓迫症狀，囊腫直徑>5cm者或包蟲囊腫、瘤性囊腫一經發現，需及早手術治療。
3、對於無症狀，直徑<4cm的單純性囊腫，可臨床繼續觀察，如增大或出現症狀再行手術。
手術方法
1、單純性囊腫有完整包膜，只需將囊腫摘除，保留正常的腎上腺。
2、瘤性囊腫，腎上腺病變廣泛時，可行腎上腺、囊腫整塊切除。
3、包蟲囊腫，在嚴密保護好周圍組織後，先行穿刺確診，吸出一定量囊液後，注入4%甲醛溶液，待殺死囊內頭節後，切開外囊，清除子囊、孫囊，再以甲醛液紗布球擦拭外囊的內壁，再剪除大部分外囊壁，由底向外逐層縫閉囊腔。
4、出血性假性囊腫多較大，先將其與周圍剝離至不能分離時，將遊離的囊壁大部切除，殘留的囊壁緣以腸線鎖邊縫合。
另外，對年老體衰或有心、腦血管疾病而不能耐受手術的患者，可在B超或CT監視下施行穿刺抽液治療。抽出囊液作檢測。抽淨囊液後，注入造影劑，如囊壁光滑，排除瘤性囊腫後，可注入適量硬化劑。穿刺抽液後應長期隨訪觀察。[5
