1.腰骶關節勞損 慢性腰骶關節勞損為持續性、瀰漫性腰痛，以腰骶部最重，脊椎活動不受限，X線無特殊改變。急性腰骶關節勞損，疼痛因活動而加理，休息後可緩解。
2.骨關節炎 常發生於老年人，特徵為骨骼及軟骨變性、肥厚，滑膜增厚，受損關節以負重的脊柱和膝關節等較常見。累及脊椎者常以慢性腰背痛為主要症狀，與AS易混淆;但本病不發生關節強直及肌肉萎縮，無全身症狀，X線表現為骨贅生成和椎間隙變窄。
3.Forestier病(老年性關節強直性骨肥厚) 脊椎亦發生連續性骨贅，類似AS的脊椎竹節樣變，但骶髂關節正常，椎間小關節不受侵犯。
4.結核性脊椎炎 臨床症狀與AS相似，但X線檢查可資鑑別。結核性脊柱炎時，脊椎邊緣模糊不清，椎間隙變窄，前楔形變，無韌帶鈣化，有時有脊椎旁結核膿腫陰影存在，骶髂關節為單側受累。
5.類風溼性關節炎 現已確認AS不是RA的一種特殊類型，兩者有許多不同點可資鑑別。RA女性多見，通常先侵犯手足小關節，且呈雙側對稱性，骶髂關節一般不受累，如侵犯脊柱，多隻侵犯頸椎，且無椎旁韌帶鈣化，有類風溼皮下結節，血清RF常陽性，HLA-B27抗原常陰性。
6.腸病性關節病 潰瘍性結腸炎、侷限性腸炎或腸原性脂肪代謝障礙(Whipple)都可發生脊柱炎，且腸病性關節病受累關節和X線改變與AS相似而不易區別，因此需要尋找腸道症狀和體徵，以資鑑別。潰瘍性結腸炎的結腸粘膜潰瘍，水腫及血性腹瀉;侷限性腸炎的腹痛、營養障礙及瘻管形成;Whipple病的脂肪瀉，急劇消瘦等，都有助於原發性疾病的診斷。腸病性關節病HLA-B27陽性性率低，Crohn病病人腸灌注液IgG增高，而AS病人腸灌液中IgG 基本正常。
7.Reiter綜合徵和牛皮癬關節炎 兩病均可發生脊柱炎和骶髂關節炎，但脊柱炎一般發生較晚，較輕，椎旁組織鈣化少，韌帶骨贅以非邊緣型為主(纖維環外纖維組織鈣化)，在相鄰兩椎體間形成部分性骨橋與AS的竹節樣脊柱不同;骶髂關節炎一般為單側性或雙?非對稱損害，牛皮癬關節炎則有皮膚銀屑病損害等可代鑑別。
8.腫瘤 腫瘤亦可引起進行性痛痛，需作全面檢查，明確診斷，以免誤診。
