作為消化系統疾病，十二指腸潰瘍的臨床表現往往不典型，僅靠臨床症狀很難確診。當患者感到自己有慢性、週期性發作的上腹不適或者其他消化不良症狀時，應懷疑是十二指腸潰瘍，同時應及時到醫院進行檢查。
下面介紹十二指腸潰瘍的幾項常規檢查方法：
1. 胃鏡檢查：胃鏡檢查是診斷十二指腸潰瘍的主要方法，雖然其名為胃鏡，但是也可對十二指腸黏膜直接觀察、攝像，還可在直視下取活組織作病理學檢查及幽門螺桿菌檢測，因此對潰瘍的診斷具有十分重要的意義。根據1964年日本畸田隆夫的分期法，將內鏡下潰瘍可分為活動期(A)、癒合期(H)和瘢痕期(S)三個病期，其中每個病期又可分為兩個階段。部分患者可能會對胃鏡檢查的過程不能忍受或心存恐懼，這時可考慮麻醉後再行胃鏡檢查(即無痛胃鏡)，以減輕胃鏡檢查的不適感。
2. X線鋇餐檢查：X線鋇餐檢查在潰瘍的診斷及胃良、惡性潰瘍鑑別診斷上的準確性不如胃鏡，常用於年紀較大，有心腦血管疾病或因其他原因而無法耐受胃鏡檢查的患者，如發現龕影，則亦有確診價值。
3. 尿素酶試驗或核素標記C13呼氣等試驗:目的在於檢測是否存在幽門螺旋桿菌感染，主要用於評價幽門螺旋桿菌根除治療後的療效。
