主要症狀 常見持續性發熱，5～11天或更久(2周至1個月)，體溫常達39℃以上，抗生素治療無效，常見雙側結膜充血，口唇潮紅，有皸裂或出血，見楊梅樣舌，手中呈硬性水腫，手掌和足底早期出現潮紅，10天后出現特徵性趾端大片狀脫皮，出現於甲床皮膚交界處，還有急性非化膿性一過性頸淋巴結腫脹，以前頸部最為顯著，直徑約1.5cm以上，大多在單側出出現，稍有壓痛，於發熱後3天內發生，數日後自愈，發熱不久(約1～4日)即出現斑丘疹或多形紅斑樣皮疹，偶見痱疹樣皮疹，多見於軀幹部，但無皰疹及結痂，約一週左右消退。
其它症狀 往出現心臟損害，發生心肌炎，心包炎和心內膜炎的症狀，患者脈搏加速，聽診時可聞心動過速，奔馬律，心音低鈍，收縮期雜音也較常有，可發生瓣膜關閉不全及心力衰竭，作超聲心動圖和冠狀動脈造影，可查見多數患者有冠狀動脈瘤，心包積液，左室擴大及二尖瓣關閉不全，X線胸片可見心影擴大，偶見關節疼痛或腫脹，咳嗽，流涕，腹痛，輕度黃疸或無菌性腦脊髓膜炎的表現，急性期約20%病例出現會陰部，肛周皮膚潮紅和脫屑並於1～3年前接種卡介苗的原部位再現紅斑或結痂，恢復期指甲可見橫溝紡。
長短不一，病程的第一期為急性發熱期，一般病程為1～11天，主要症狀於發熱後即陸續出現，可發生嚴重心肌炎，進入第二期為亞急性期，一般為病程11～21天，多數體溫下降，症狀緩解，指趾端出現膜狀脫皮，重症病例仍可持續發熱，發生冠狀動脈瘤，可導致心肌梗塞，動脈瘤破裂，大多數病人在第4周進入第三期即恢復期，一般為病程21～60天，臨床症狀消退，如無明顯冠狀動脈病變即逐漸恢復;有冠狀動脈瘤則仍可持續發展，可發生心肌梗塞或缺血性心臟病，少數嚴重冠狀動脈瘤患者進入慢性期，可遷延數年，遺留冠狀動脈狹窄，發生心絞痛，心功能不全，缺血性心臟病，可因心肌梗塞而危及生命。
