慢性淺表性胃炎和慢性萎縮性胃炎同屬於慢性胃炎，二者臨床表現極為相似，故區分慢性淺表性胃炎和慢性萎縮性胃炎要結合相關輔助檢查，尤以胃鏡和胃粘膜活檢為重要。二者主要區別如下：
(1)胃粘膜活檢：慢性淺表性胃炎的基本病變是上皮細胞變性，小凹上皮增生及固有膜內炎性細胞的浸潤，亦偶可見到表面上皮及小凹上皮腸化生。本病的炎性病變主要累及胃粘膜淺層，有時也可累及深層。國內病理專業組討論規定，按炎症細胞浸潤深淺度，淺表性胃炎可分為輕、中、重三級。
胃粘膜自表面至深部分成三等分，細胞浸潤僅累及表淺1/3者為輕度，累及2/3以內者為中度，超過2/3者為重度。無論炎性病變輕重如何，淺表性胃炎的胃腺體(賁門腺、胃底腺、幽門腺)始終正常，沒有破壞或數目減少。淺表性胃炎進一步發展，其固有腺因炎症破壞而減少，可轉化成萎縮性胃炎。
慢性萎縮性胃炎，是以胃粘膜固有腺萎縮(數量減少、功能減低)為其突出病變，常伴有腸上皮化生及炎性反應。按影響固有腺的程度，將慢性萎縮性胃炎分為輕度、中度及重度三級。胃的固有腺(在胃竇部為幽門腺、胃底部為胃底腺、在賁門為賁門腺)減少1/3者為輕度，減少1/3～2/3者為中度，減少2/3以上者為重度。
(2)胃鏡檢查：慢性淺表性胃炎在胃鏡下的表現主要有：①胃粘膜充血、水腫，充血區和水腫區可交叉存在，形成紅白相間，並以充血的紅色為主;②胃粘膜表面附著粘稠的灰白色或淡黃色粘液斑;③胃粘膜有出血點;④有時粘膜上可看到小的糜爛。
