該病需要與伴膽脂瘤的慢性化膿性中耳炎、慢性鼓膜炎、中耳癌、結核性中耳炎等相鑑別。
中耳癌為發生於中耳的少見惡性癌腫,多為原發。中耳癌的誘因,很可能是中耳的長期感染,據統計,多數中耳癌患者有慢性化膿性中耳炎的病史。其發病年齡多為40~60歲,本病病理是以鱗狀上皮細胞癌最常見,基底細胞癌和腺癌在中耳很少見。
結核性中耳炎就是結核桿菌感染。主要繼發於肺結核,亦可由腺樣體結核或骨,關節結核及頸淋巴結結核等播散而來,病菌可循咽鼓管侵入中耳,而經血液循環或淋巴系統傳入中耳和乳突。外耳結核罕見,結核性中耳乳突炎偶有報告。