皮膚粘膜淋巴結綜合徵的特點是起病初即表現為發熱，而且多為高熱，體溫常常達39℃以上，而且持續高熱5天以上，抗生素治療無效。在高熱過程中，患兒可出現雙眼球結合膜充血(眼睛紅)，口唇乾裂，舌乳頭充血並且突起，狀似楊梅。同時，軀幹可出現多形性紅斑，類似猩紅熱皮疹。在急性期，手足會出現堅實性腫脹，持續一週左右，在指趾的末端沿指甲與皮膚交界處出現膜狀脫皮。頸部淋巴結多有腫大。
相當多的患兒在早期出現心肌炎和心包炎體徵，有的患兒可見心臟擴大，或可見冠狀動脈受侵。伴發冠狀動脈受侵、心肌炎或心包炎的患兒病死率很高。
對皮膚粘膜淋巴結綜合徵的患兒，在急性期應給予大劑量阿司匹林治療，在發熱期劑量應按每日每公斤體重50-100mg計算，熱退後劑量可減半，以後逐漸減量，持續應用2～6個月。阿司匹林能夠抑制血小板聚集，從而防止血栓形成和冠狀動脈阻塞。
中藥對本病的治療亦有很好的效果。在發熱期，中藥應以清熱解毒法治療為主，並配合應用活血化瘀藥。在恢復期，中藥應側重滋陰清熱。
