1.大多數十二指腸潰瘍穿孔患者有潰瘍病史，其腹痛劇烈，連續的刀割樣疼痛，有時引起患者休克，腹壁明顯強直，常為 "板狀"，壓痛，反跳痛；腸鳴音消失；腹部X線檢查可發現膈肌下有遊離氣體。其中第一種是小穿孔，第二種是慢性穿孔，這可能難以診斷。
2.急性胰腺炎腹痛多位於上腹或左側，體徵不如急性膽囊炎明顯，Murphy徵陰性；血清澱粉酶明顯升高；B超顯示胰腺腫大，邊界不清，無急性膽囊炎體徵；CT檢查比B超診斷急性胰腺炎更可靠，因為B超常因腹脹而無法顯示胰腺。
3.高位急性闌尾炎為轉移性腹痛，腹壁壓痛，腹肌強直可侷限於右上腹，易誤診為急性膽囊炎，但超聲檢查無急性膽囊炎體徵，羅氏徵（Rovsing）陽性（按壓左下腹可引起闌尾疼痛）有助於鑑別。
膽囊炎反覆發作的病史和疼痛的特點對鑑別診斷也有參考價值。
4.急性腸梗阻的絞痛多位於下腹部，常伴有腸鳴音亢進、"金屬音 "或氣過水音，腹痛無放射，腹肌不緊張，X線檢查可見腹腔內有液體平面
5.右腎結石發熱少見，患者多伴有腰痛，向會陰部放射 患者有腎區叩擊痛，肉眼血尿或鏡下血尿，X線腹部平片結石陽性，B超檢查有腎結石或伴腎盂擴張。
6.右側大葉性肺炎和胸膜炎患者也可有右上腹痛、壓痛和肌肉守護，與急性膽囊炎相混淆，但早期往往有高熱、咳嗽、胸痛等。胸部檢查時呼吸困難，可聽到囉音或胸膜摩擦音。
7.冠心病的心絞痛常有上腹中部或右上腹的疼痛，如果被誤診為急性膽囊炎而進行麻醉或手術，有時可導致立即死亡。
8.急性病毒性肝炎伴有急性重度黃疸，可有類似膽囊炎的右上腹痛和肌肉守護，發熱，白細胞計數增高和黃疸，但肝炎患者常有食慾不振、乏力、低熱等前驅症狀；體檢常發現肝區廣泛壓痛，白細胞一般不增高，肝功能明顯異常，一般不難區分。
