胸腺切除在治療重症肌無力方面起著重要的作用，是治療重症肌無力的重要措施之一。從最初的胸骨縱行切開、小切口胸腺切除，到當前的微創手術（胸腔鏡下胸腺切除術、機器人輔助胸腺切除術等），醫生和患者都為手術方式的改進做出了巨大貢獻。
1、胸骨正中切開胸腺切除術
患者支氣管靜脈全身複合麻醉以後，依次切開皮膚、皮下，用胸骨鋸縱行切開胸骨，撐開胸骨後暴露胸腺。分離胸腺以及胸腺周圍的脂肪組織，仔細止血後關胸。此手術方式的優點在於能夠在直視下儘可能將胸腺以及其周圍的脂肪組織切除乾淨；而缺點在於手術切口較大（約14M），患者術後疼痛明顯，術後住院時間較長，容易引起感染。
2、胸骨橫斷小切口胸腺切除術
患者支氣管靜脈全身複合麻醉以後，在第2肋間橫行依次切開皮膚、皮下，用胸骨鋸橫行切開胸骨，用小的撐開器撐開橫斷的胸骨，離斷胸腺的血管，並分離胸腺及其周圍的脂肪組織，仔細止血後關胸。此手術方式的優點在於與傳統的縱行切開相比切口較小（長6-8M），術後恢復較正中切開快。
3、胸腔鏡（VATS）或機器人輔助胸腺切除術
患者支氣管靜脈全身複合麻醉以後，在右側胸壁第2肋間和第4肋間切開約4M和1.5M孔或者在劍突下切開3個1M小孔，依次分離胸腺以及胸腺周圍的脂肪組織，仔細止血後關胸。此手術方式的優點在於與開胸手術相比，手術切口很小（一共長約5M），術後疼痛較小，恢復快，住院時間短，術後危象發生率低；對隨訪患者的回顧性研究發現，在胸腺切除治療重症肌無力的臨床療效上，VATS能夠達到和其他手術方式一樣的臨床效果。
隨著手術技術以及手術器械的發展，胸腺切除已經從以往的開胸手術切除，逐漸走上了微創治療的道路。國內外諸多研究者也對各種手術方式治療重症肌無力的臨床療效進行對比，其結果發現：雖然各種手術方式在重症肌無力總有效率方面差異不明顯，但是微創技術能夠更大程度上減少住院時間和術後切口疼痛，使得手術患者能夠更樂意地選擇自己能夠承受的方式進行手術。
然而，對於侵犯周圍組織（如血管，神經，心包等），微創手術不具備開胸手術所擁有的優勢。在臨床實踐之中，醫生需要結合患者的具體情況，優化手術方案，以使患者的痛苦和風險降至最低。在特殊情況下，需要三種手術方式相輔相成，希望儘可能地切除幾乎所有的胸腺腫瘤。
需要指出的是，重症肌無力患者在切除胸腺後並不代表疾病治癒，仍需要神經內科的長期藥物治療，不能擅自減藥或停藥，以免帶來肌無力病情的加重或反跳。總之，重症肌無力是非常複雜的自身免疫性疾病，需要內科和外科相結合的方式來治療。
