迄今為止，雖然這個病的治療方法很多，但仍缺乏特殊有效的方法。國外大多采用抑制雌激素類藥物、維生素類藥物、止痛藥或預防性手術治療。國內則採用中醫中藥治療，
激素治療的開始階段多會有較好的療效，但應用的時間及劑量很難掌握，往往會出現矯枉過正之弊。應用不當，可能會加重內分泌紊亂。目前激素療法已很少作為常規的治療。
維生素A、B、C、E等能改善肝臟功能、調節內分泌代謝、同時還能改善植物神經的功能，可以作為該病的輔助用藥。維生素E是一種抗氧化劑，可以降低低密度脂蛋白增加孕激素，能夠緩解乳房疼痛、縮小結節，但複發率高療效多不明顯。
對於乳房疼痛無法忍受的患者，可以短時期內服用止痛藥以緩解疼痛。
乳腺增生病本身沒有手術治療的指徵，手術治療的目的主要是明確診斷，避免乳腺癌的漏診或延誤。隨著研究者對該病的深入研究，專家們發現乳腺增生病與乳腺癌的發生有一定的關係，但不是所有的乳腺增生病患者都會變成乳腺癌，只有少數患者是癌前期病變。所以早期治療就顯得尤為重要！若乳腺增生病腫塊較大、質地較硬，伴有乳頭血性溢液，經治療症狀不緩解，腫塊反而繼續增大或變硬，建議患者手術治療。對於那些絕經後新出現的乳房腫塊，或有乳腺癌家族史，或病理檢查支持的，也建議手術治療。
中醫藥以其獨特的優勢，目前已經成為治療該病的主要方法。
中醫認為該病分為肝鬱痰凝和衝任失調兩種類型。對於經常情緒失調的病人，多給予疏肝理氣的藥物治療。對於伴有月經不正常的女性，多配合調理月經的藥物。內服中藥的時間因人而異，經過治療後腫塊消失，乳痛消除，便可以停藥。症狀輕者，一般服藥3個月左右；症狀重者，需服藥1-2年。月經期間停服中藥。
