残损脑细胞的修复及脑细胞功能重塑代偿等机制必须在大脑内环境稳定的状态下才能发挥高效作用。颅骨的完整性、颅内容物（脑组织、血液、脑脊液）的稳定是维持脑功能内环境稳定的基础。而颅骨密闭性的变化、脑组织体积的变化、血液供应的增减、脑脊液循环流动的变化都会导致颅内环境的紊乱。其中脑损伤后颅骨缺损、脑积水、颅内积液、脑组织缺失萎缩这些常见的并发症都是影响脑功能康复的阻碍因素。
上述并发症的处理即是颅脑结构性重建的过程，颅脑结构性重建后脑细胞修复功能重建的过程才能实现。这些并发症的评估与处理需要在康复训练实施前完成，这样才能保证受损的脑功能最高效、最大化的恢复。做个比喻，颅骨的密闭性好似房间的空调系统、脑血流好似房间的电路系统、脑脊液循环好似房间的上下水系统，只有把上述各系统调控于稳定的工作状态，这个房间才会是一个有完善功能的房间，生活在房间里的人脑细胞才能有活力。
