對無症狀的原發性血小板增多症是否採用降低血小板計數的治療仍有爭論。一般而言，很少有證據表明長期降血小板治療能改善無症狀患者的預後。與預防性降血小板治療無症狀患者以防止止血併發症發生存在爭論的情況相反，對有出血或血栓形成的患者降低血小板可以改善症狀已有共識。患者有指、趾微血管缺血或腦血管缺血癥狀時，應積極進行降血小板治療。目標為降低巨核細胞增殖和血小板的生成。
1.急性有危險的出血或血栓患者可用血細胞分離儀單採血小板 此法降低血小板是短時的其後會出現反跳，需與骨髓抑制劑協同使用。32P和烷化劑如苯丙氨酸氮芥(馬爾法蘭)、白消安(馬利蘭)、塞替派、氧芬胂(苯丙酸氮芥)等以往使用較多，現在傾向於放棄使用，因其有致白血病的可能。
2.骨髓抑制性藥物 白消安為常用有效的藥物，宜用小劑量，開始4～6mg/d。如要求血小板快速下降可選用羥基脲2～4g/d，3～4天后減至1g/d。環磷酰胺，苯丁酸氮芥，馬法蘭等都有效。當血小板數下降或症狀緩解後即可停藥。如有復發可再用藥。
羥基脲的治療 羥基脲非烷化劑骨髓抑制劑，對本病有很好的療效。開始劑量每天10～30mg/kg。因可引起快速骨髓抑制，開始7天內應檢查血細胞計數並在以後監控。維持劑量需個體化，根據血細胞計數調整用藥劑量。約80%患者在8周內可使血小板降至500×109/L以下，並可長期控制血小板數。
羥基脲的骨髓抑制作用較輕，可通過調整用藥量避免嚴重的骨髓抑制。一些病人有輕度的胃腸道反應，有的病人可出現口腔黏膜潰瘍。與其他化療藥物可以提高白血病的發生相似，羥基脲也有提高白血病發生的副作用。在羥基脲治療的原發性血小板增多症病人中，發生的急性粒細胞白血病和骨髓增生異常綜合徵很大比例呈染色體 17P缺失和其他17P-綜合徵的特徵。
3.阿那格雷(氯咪喹酮)對降低血小板計數非常有效，現已是一線治療藥物之一。它能通過抑制骨髓巨核細胞成熟而降低血小板。開始劑量0.5mg，4次/d，或1mg，2次/d。控制血小板需要的劑量一般成人2.0～3.0mg/d。約11天可降低一半血小板計數。此藥不影響白細胞計數，少數病人可發生血容量輕度降低。病人服藥期間血小板計數可以控制得很好，但停藥後大多數病人血小板計數迅速上升。副作用有神經和消化道症狀、心悸及體液瀦留。
4.重組α-干擾素 為治療本病的有效藥物，可抑制異常巨核細胞克隆的分化，降低巨核細胞的大小和倍增。大多數患者用於擾素治療1個月，血小板計數可降至正常或接近正常範圍。開始劑量皮下注射干擾素， 300萬U/d，血小板接近正常後根據個體的治療反應和耐受性調整劑量，以後可用較小劑量每週3次皮下注射維持多年。停止使用後血小板可增多、復發。主要為流感樣副作用，可有發熱、關節肌肉痠痛等，減少劑量或解熱止痛藥可減輕或緩解。干擾素治療可伴有白細胞計數下降。
5.阿司匹林：是有效的輔助治療藥物，對指、趾缺血和腦血管缺血癥狀特別有效。缺點是在有些患者可引起嚴重出血，使出血時間顯著延長。因而使用時需慎重。
6.放射核素磷(32P) 口服或靜脈注射，首次劑量0.08～0.11MBq，如有必要三月後再給藥一次。一般不主張應用，因為誘發白血病的可能。
