除了對胃腸道和腎臟的副作用外，非甾體抗炎藥也會對其他器官電產生一些副作用。
有些NSAIDs可產生輕微的神經系統副作用，常見的症狀有頭痛；頭暈、耳鳴、失眠和感覺異常。在中毒的情況下會出現譫妄、抽搐、昏迷和其他嚴重症狀。非甾體抗炎藥對血液系統也有一些影響，其中粒細胞減少和再生障礙性貧血最為常見。
較高劑量的水楊酸製劑可抑制血小板凝集，降低其相互粘連的能力，從而延長出血時間。在合併有血管病變的情況下，它往往能誘發嚴重的出血，因此應謹慎使用，尤其是對有腦血管病變的人。
當有人工心臟瓣膜或血管栓塞的患者使用抗凝劑時，應減少NSAIDs的用量以防止大出血。肝臟受損、維生素缺乏的病人和術前病人應謹慎使用水楊酸鹽。非甾體抗炎藥如阿司匹林和消炎痛可有肝臟損害，常見的症狀有黃連素瘤、轉氨酶升高、噁心和嘔吐。此外，皮疹和過敏反應也不少見，嚴重的過敏反應甚至會導致哮喘和休克。如果遇到上述情況，應迅速送醫院進行搶救。
