(一)傳染源 鼠疫為典型的自然疫源性疾病，在人間流行前，一般先在鼠間流行。鼠間鼠疫傳染源(儲存宿主)有野鼠、地鼠、狐、狼、貓、豹等，其中黃鼠屬和旱獺屬最重要。家鼠中的黃胸鼠、褐家鼠和黑家鼠是人間鼠疫重要傳染源。各型患者均可成為傳染源，以肺型鼠疫最為重要。敗血性鼠疫早期的血有傳染性。腺鼠疫僅在膿腫破潰後或被蚤吸血時才起傳染源作用。
(二)傳播途徑動物和人間鼠疫的傳播主要以鼠蚤為媒介。當鼠蚤吸取含病菌的鼠血後，細菌在蚤胃大量繁殖，形成菌栓堵塞前胃，當蚤再吸入血時，病菌隨吸進之血反吐，注入動物或人體內。蚤糞也含有鼠疫桿菌，可因搔癢進入皮內。此種“鼠→蚤→人”的傳播方式是鼠疫的主要傳播方式。 少數可因直播接觸病人的痰液、膿液或病獸的皮、血、肉經破損皮膚或粘膜受染。 肺鼠疫患者可借飛沫傳播，造成人間肺鼠疫大流行。
(三)人群易感性人群對鼠疫普遍易感，無性別年齡差別。病後可獲持久免疫力。預防接種可獲一定免疫力。
(四)流行特徵
1.鼠疫自然疫源性世界各地存在許多自然疫源地，野鼠鼠疫長期持續存在。人間鼠疫多由野鼠傳至家鼠，由家鼠傳染於人引起。偶因狩獵(捕捉旱獺)、考查、施工、軍事活動進入疫區而被感染。
2.流行性 本病多由疫區籍交通工具向外傳播，形成外源性鼠疫，引起流行、大流行。
3.季節性與鼠類活動和鼠蚤繁殖情況有關。人間鼠疫多在6～9月。肺鼠疫多在10月以後流行。
4.隱性感染 在疫區已發現有無症狀的咽部攜帶者。
