對中樞神經系統的作用
石菖蒲有鎮靜作用。煎劑或揮發油均能使小鼠自發活動減少， 石菖蒲解除單籠飼養小鼠的攻擊行為;亦能延長戊巴比妥鈉所致的睡眠時間，對閾下催眠劑量的戊巴比妥鈉有協同作用。此外， 尚能顯著延長戊巴比妥鈉的麻醉時間。研究表明：揮發油中的細辛醚是鎮靜的有效成分，但除去揮發油後仍有鎮靜作用， 提示其鎮靜成分不只一種。
石菖蒲煎劑對戊四氮引起的小鼠驚厥有一定的對抗作用，與對照組相比， 能使自主活動減少，抽搐開始時間推遲， 抽搐鼠數較少。揮發油中的α-細辛醚140mg/kg能完全對抗小鼠電驚厥和戊四氮驚厥，並能對抗家兔側腦室給Ach所致驚厥，除去揮發油的水煎劑亦有作用。
石菖蒲揮發油對小鼠有較強的降溫作用。石菖蒲根莖水提取物製成的片劑， 在臨床上用於治療癲癇病及其他神經系統疾患，有較好療效， 其揮發油對某些神經系統的動物模型具有顯著的生理活性。
對心血管系統的作用石菖蒲揮發油(β-細辛醚)在一定濃度下有使豚鼠冠狀血管擴張的作用。臨床常用於冠心病、肺心病等屬於痰濁氣滯之胸痺者的治療，其機制可能與其能增加冠脈流量有關， 還可能與鎮靜、改善消化機能、平喘、鎮咳等作用有關。
對消化系統的作用石菖蒲煎劑內服能促進消化液的分泌及制止胃腸異常發酵，並有緩解腸管平滑肌痙攣的作用。石菖蒲中含的細辛醚能對抗氯化鋇引起的離體腸管的興奮作用。
抗真菌作用菖蒲水浸劑(1：3)， 在試管內對堇色毛癬菌、同心性毛癬菌、許蘭黃癬菌、奧杜盎小芽胞癬菌、鐵鏽色小芽胞癬菌、羊毛狀小芽胞癬菌、腹股溝表批癬菌、紅色表皮癬菌、考夫曼-沃爾夫表皮癬菌、星形奴卡菌等皮膚真菌均有不同程度的抑制作用。
其他作用石菖蒲中所含的α-細辛醚有平喘作用，能對抗組胺引起的支氣管收縮， 並有鎮咳作用。臨床上對支氣管哮喘患者的肺通氣功能有改善作用。
