1、藥物治療：
1、抗生素的使用：
化腦預後好壞與是否早期明確病原菌，選擇恰當的抗生素進行治療密切相關。經腦脊液檢查初步確診後，應儘快由靜脈給予適當、足量的抗生素，以殺菌藥物為佳，並根據病情按計劃完成全部療程，不可減少藥物劑量與改變給藥方法。始終不能明確病原菌者，多由於診斷未明時曾不恰當使用抗生素所致。如在流腦流行季節，年長兒童一般應先考慮系腦膜炎雙球菌所致，如有瘀點、瘀斑則更可疑。可先用青黴素、氨苄青黴素、磺胺治療，再根據反應高速用藥。病原菌未確定的散發病例，尤其嬰幼兒，應先按病原未明的化腦治療，特明確病原菌之後，再更改藥物。目前多主張用三代頭孢菌素，如頭孢三嗪噻肟、頭孢氨噻肟或二代頭孢菌素如頭孢呋肟。治療效果滿意時，體溫多於3天左右下降，症狀減輕，腦脊液細菌消失，細胞數明顯減少，其它生化指標亦有相應好轉，此時可繼用原來藥物治療，二週後再複查腦脊液。如治療反應欠佳，需及時腰穿複查，觀察腦脊液改變，以確定所用藥物是否恰當，再酌情調整治療方案。鑑於化腦是一嚴重中樞神經系統感染，其預後與治療密切相關，故應嚴格掌握停藥指徵，即在完成療程時症狀消失、退熱一週以上，腦脊液細胞數數少於20×106/L，均為單核細胞，蛋白及糖量恢復正常(流腦停藥指徵見另章節)。一般情況下，完全達到這些標準，少需8～10天，多則需1月以上，平均2～3周左右。
2、注意事項：
(1)病兒年齡對抗生素選擇有一定的指導意義，如年長兒童患流感桿菌腦膜炎較少，新生兒化腦大多數是腸道病菌感染，氨基糖類藥物和青黴素，因慶大黴素、丁胺卡那黴素對腸道革蘭氏陰性桿菌有效，而青黴素對鏈球菌、肺炎鏈球菌、腦膜炎雙球菌均有效。也可選用氨苄青黴素這一廣譜抗生素代替青黴素，耐藥菌株可用按苄青黴素加頭孢氨噻肟。新生兒尤其未成熟兒一般忌用氯黴素，因其肝、腎發育尚未成熟，對氯黴素的代謝、排洩功能尚不健全，易引起中毒，表現為“灰嬰綜合徵”，甚至休克死亡。
